يعيش بلو ورفيق روحه معًا في ريو دي جانيرو وأنجبا ثلاثة أطفال، ولكن عندما يكتشفان أن طائرًا آخر من فصيلتهما قد تم رصده في قلب الأمازون، يدركان أنهما ليسا آخر من بقي كما كانا يعتقدان ويقرران الذهاب في رحلة عائلية لاكتشاف أصولهما. لن يكون من السهل التكيف، وخاصة بالنسبة لبلو، الأبعد عن قواعد عالم الحيوان، ولن يساعد أن ميغيل، الذي نجا بأعجوبة من الفيلم السابق، قد رصدهم وقرر متابعتهم بهدف الانتقام.
