ある日、世界中のありとあらゆる動物たちが集められる。大洪水が襲ってくるまえに “ノアの箱舟"に乗って出航するためだ。しかし、乗られるのは乗船者リストに名前が載っているものだけ。 ライオンが管理するリストに入っていない不思議な動物“ネストリアン"の親子、デイヴとフィニーは乗ることが許されない。そこにたまたま出くわす肉食動物“グリンプ"の母娘、ヘーゼルとリア。デイヴ親子は、彼らと同じグリンプに成りすましてどうにか箱舟に忍び込むことに成功する・・・・・・が、出航した箱舟にフィニーとリアの姿がなかった!遊びに熱中しすぎてうっかり船から落ち、陸に取り残されてしまったふたりは、腹を空かしたコウモリ夫妻に狙われるなか、愛する家族が待つ箱舟に戻ることができるのか!
