宇宙戦艦ヤマト

冥王星付近で謎の艦隊との戦いを繰り広げる、地球防衛軍艦隊。敵の技術力は圧倒的に高く、地球側の武器はほとんど歯が立たないまま、みるみるうちに 撃破されてしまう。自らの艦も損傷を受けた司令官の沖田十三は、残る古代守指揮のミサイル艦に撤退を命じて退却するが、古代守は男の意地をかけて最後の戦いに挑んでい くのだった。 　 そのころ地球では、火星に墜落してゆく未確認飛行物体がキャッチされていた。火星の基地にいた訓練生の古代進と島大介は、指令を受けてその未確認飛行物体を追跡。墜落した機体から脱出した謎の美女が持っていた通信カプセルを地球防衛軍本部に送り届ける。 　 そのカプセルには、はるか１４万８千光年彼方のイスカンダル星からもたらされた重要なメッセージが記録されていた。それは、ガミラスの攻撃で放射能汚染され、もやは滅亡を待つのみの地球の希望をつなぐものだった。

地球では、各都市からの通信が途絶しつつあった。帰還した沖田は、訓練生の古代と島を呼び出した。二人は案内されるまま、宇宙戦艦とおぼしき艦の艦橋に立つ。外からは、ガミラス艇が執拗に攻撃を仕掛けてきており、宇宙からは空母が接近してきていた。沖田は古代と島に、この艦こそ戦艦大和を甦らせた宇宙戦艦ヤマトであること、そしてその使命について説明する。そして補助エンジンをスタートさせると、総員配置につけ、と命じるのであった。

始動した宇宙戦艦ヤマトを撃破しようと、ガミラスは冥王星基地から超巨大ミサイルを発射する。そのころ地球では、沖田艦長によるヤマト航海計画の説明が行われ、乗組員は地下都市をパレードして多くの市民に見送られつつヤマトに乗船する。沖田は航海の危険性について語り、乗艦拒否も受け入れる姿勢を示したが、ヤマトには全員が乗艦した。 　巨大ミサイルを感知した地球防衛軍司令部は、ヤマトに撃破を命じる。沖田艦長の命令で、島大介は波動エンジンを始動させようとするが…。

地球を飛び立ったヤマト。沖田艦長は早速、ワープテストを実施しようとする。ワープとは、光速を超える速度で航行し、時空に歪みを生じさせて一気に「ジャンプ」する航法である。もし失敗すれば、宇宙そのものが崩壊してしまう可能性もあるという。まずはテストとして、月から火星へのワープを試みるヤマト。しかし、超巨大ミサイルでの撃破に失敗したガミラスは、冥王星基地から空母を出撃させて、ヤマトを迎撃しようとしていた。

火星で外装の損傷を修復したヤマトは、木星付近を航行していたが、波動エンジンの不調で木星の重力場に捉えられ、メタンの厚い層で覆われた木星の表面へと引き込まれていく。そこで、メタンの海に浮かぶ浮遊大陸を発見。着陸して波動エンジンの修理に取りかかった。冥王星の前線基地からこの様子を見ていたガミラスのシュルツ司令官は、浮遊大陸にある基地に、ヤマト偵察を命じる。これに対して古代進がコスモゼロで発進、敵偵察機と浮遊大陸上空で航空戦を繰り広げるのだった。 　偵察機が撃墜されると、ガミラス基地からのミサイル攻撃が始まる。修理を完了したヤマトはエンジンを始動、間一髪で離陸に成功した。ガミラス基地があることが明らかになった浮遊大陸を、古代は波動砲で攻撃することを提案。真田と島は反対するが、沖田は今のうちにテストを敢行しようと、古代に波動砲の発射を命じる。

初の波動砲発射後、再び波動エンジンが不調を来たし、エネルギー伝導管が焼き付いてしまう。修理に必要な鉱物資源「コスモナイト」を採掘するため、沖田艦長は土星の衛星タイタンにヤマトを着陸させる。そして古代、森、アナライザーの３名にコスモナイトの探査と採掘を、そして真田にはチームを編成して必要な物資を積み込むよう命じた。 　そこへ、ガミラスの偵察機が飛来する。沖田艦長は真田班と古代班に撤収を命じるが、古代はコスモナイト鉱石を何とか見つけ出そうと、命令を無視して探査を続ける。

ヤマトは冥王星の周辺を航行していた。古代らは、冥王星のガミラス基地から地球へ向かって遊星爆弾が飛翔していくのを目の当たりにし、これ以上地球が遊星爆弾の攻撃に脅かされることがないように、冥王星基地を叩くことを提案する。沖田艦長もそれに同意するが、惑星の環境を破壊してはならないと、波動砲は使わないことを明言した。 　一方ガミラス基地では、シュルツ司令がヤマトを撃破しようと、最終兵器「反射衛星砲」による攻撃を企てていた。

冥王星の海へ沈んだヤマト。艦長の沖田は、艦底を上にしてヤマトを回転させ、「死んだふり」作戦を敢行する。そしてメインスタッフは第三艦橋に移動すると、古代、真田、アナライザーらを反射衛星砲爆破の決死隊として送り出した。しかし決死の攻撃を仕掛けるガミラスとの水中戦で酸素供給装置が破損し、８時間後にヤマトには冥王星を脱出しなければならなくなる。 　一行は排気筒を目標に探索を進めるが、なかなか見つからない。真田の要請で、沖田艦長はヤマトを浮上させ、ガミラスに反射衛星砲を「撃たせる」のだった。一方のガミラス側では、シュルツ司令が、ヤマトの動きの不審さに気付きはじめる…。

ヤマトの攻撃により冥王星の前線基地を失ったガミラスのシュルツ司令。このままでは祖国ガミラスには帰れないと、ヤマトへ最後の戦いを挑むことを決意する。一方のヤマトは、冥王星での戦闘で大きな損傷を受けたヤマトを補修する必要があった。敵影を発見したヤマトは、かつて太陽系にあった１０番目の惑星の残骸である小惑星帯アステロイド・ベルトへ姿を隠す。航行の最中、真田は安全に補修を行い、いざというときの攻撃に備えるためのプランを温め、沖田艦長に提案する。それは、小惑星を反重力によって遠隔操作し、ヤマトの周囲に集めてヤマト本体を小惑星に偽装するというアイデアだった。

いよいよ太陽系から出ようとするヤマトへ、地球防衛軍司令長官の藤堂から最後の通信が入る。藤堂は地球の窮状を彼らに伝え、ヤマトが遠くに離れていくにつれ、地球の人々がヤマトの帰還に絶望的になっていることを知らせる。しかしその通信は途中で途切れてしまう。大ワープ敢行の前に決意を新たにする必要性を感じた沖田艦長は、ヤマトの乗組員全員に、地球で待つ家族への通信を許可。家族の口から伝えられる地球の現状を胸に、使命感を燃え立たせようとするのだった。 　通信室に、順に入っていき家族と交信する乗組員たち。しかし古代はあてもなく、艦内を彷徨う。その先で彼は、同じように落ち着きなく歩き回る沖田の姿を目撃する。

太陽圏を出て航海を続けるヤマトに、ガミラス帝国も注目し始めていた。副総統のヒスはヤマトのこれまでの戦いについて報告する。しかし太陽圏を出た先には「デスラー機雷」が敷設されており、タラン将軍は、この機雷にかかって沈むヤマトを夕食後の座興にと用意したことを説明する。 　機雷の存在に気付いたヤマトは航路を変更するが、やがてそのヤマトを追うように機雷が近づいてくることに気付く。ガミラス科学の粋を尽くしたデスラー機雷と沖田艦長の知謀をめぐらす戦いが始まった！

展望室で星を眺めて、オリオン座の星の一つに願いごとをする森雪。その姿を見かけた古代は、何をしているのかと問いかける。そんな中、突然ヤマトは航行に支障を来す。超磁力バリアによって、行く手が阻まれてしまったのだ。 　バリアはデズラーの仕掛けた罠で、ヤマトはバリアを避けて前進すれば赤色巨星のコロナに焼かれ、下がればガス生命体の餌食となる、という八方ふさがりの状況に追い込まれる。進退窮まる中、沖田艦長は前進を命じ、ヤマトは立ち上る赤色巨星のコロナを回避しながら進んでゆくが・・・

ガミラス星のデスラー総統府では、戦線から帰国したドメル将軍にデスラー総統から勲章が授けられた。叙勲の席でドメル将軍は、ヤマトを「ひねりに行く」ことをデスラーに約束する。 　その頃ヤマトでは、古代進がブラックタイガー隊とともに航路パトロールに出ていた。そこでガミラス軍の戦闘機部隊と遭遇。被弾した１機の戦闘機を拿捕し捕虜をヤマトに連れ帰る。敵であるガミラス星人との初遭遇に、身体検査をする佐渡先生の医務室は黒山の人だかりとなった。しかし検査のため衣服を脱がせると、肌の色以外まったく地球人と同じ人間が現われ、その場は騒然となる。その敵の姿に古代は逆上し、医務室に乗り込むとメスを手に取ってガミラスの捕虜に斬り掛かろうとする。古代の心の中にはガミラスに対する強い憎しみがあったのだ・・・

オクトパス星団ですでに３週間も足止めされているヤマト。艦内では乗組員たちの間にイライラが募っている。航行スケジュールでは４５日で中間地点のバラン星に着いていなくてはいけないが、まだ銀河系を出たところですでに６０日の遅れが出ていた。島は作戦会議で、星団の向こう側に抜ける海峡があり、そこを通れば難所を短時間で切り抜けられるとして嵐の収束を待つことを主張する。しかし古代は「本当に海峡があるのか」と疑い、コスモゼロで偵察に出かけるが・・・

無事オクトパス星団を抜けて外宇宙へ出たヤマトは、順調に航行を続けていた。航海班は森雪からコーヒーを振る舞われ、その微妙な味に軽口を叩いている。 　イスカンダル星への中間地点にあるバラン星に、ドメル将軍率いる大艦隊が到着する。銀河方面基地司令官のゲールは副司令に降格になったうえ、ドメルから部屋の装飾が悪趣味であると叱責を受ける。さらにドメルは、四次元演習場で大演習を行うことを告げる。 　戦闘班は格納庫で戦闘機の整備にいそしんでいた。何もかも順調かと思われたそのとき、ヤマトは波動エンジンがストップしてしまい、水素気流に巻き込まれてしまう。やがて漂流したヤマトは不気味な空域、異次元空間に迷い込んでいた。そこに、ガミラスの戦艦が現れる。

中間地点バラン星へ近づいたヤマトでは、隊員たちが日光浴をし、リラックスするなどして過ごしていた。食事はワンパターン化し飽きられていたが、森雪はワンピース姿を披露して気分転換をすすめる。しかしせっかくのお洒落もアナライザーのスカートめくりで台無しになってしまう。一方、艦内では野菜不足が深刻になっていた。沖田艦長は生活班長の森雪を呼び、近くのビーメラ星に降下して食べられる野菜を探してくるよう命じる。アナライザーとともに未知の惑星に降下した森雪だったが操縦ミスで乗機が墜落、二人は先住民に捕らえられてしまう・・・

ヤマトが目指す中間地点バラン星は、恒星のない単独の浮遊惑星で、地表では活発な火山活動があり、地熱によって生息する生物もいるという。そしてそこには、地球侵攻のためのガミラス軍の最前線基地があった。ドメル将軍の赴任によって基地司令から副司令に降格となったゲールは、戦功をあげて失地を回復しようとたくらむ。バラン星に生息する原生生物バラノドンを調教し、大量の個体に１つの隊形を組ませて巨大な宇宙怪獣に仕立てあげ、ヤマトを攻撃しようとした。一方ヤマトでは、沖田艦長の病状が悪化。ついに手術することになるが・・・

イスカンダルへの中間地点バラン星を目指すヤマトは、なぞの宇宙要塞の出現で足止めされてしまう。偵察機を飛ばしてみると、なんとその要塞に近づいたとたん、機体がバラバラに分解してしまったのだ。その原因は、要塞から発信されているマグネトロンウェーブであることを突き止める。宇宙要塞はヤマトの動きにあわせて追随しており、この要塞によって「バラバラ」にされてしまわないためには、要塞内部から爆破する必要があった。技術班長の真田は早速シームレス機を開発し、自ら要塞に爆弾を仕掛ける決死隊に志願する。

ヤマトは中間地点バラン星まであと４日のところまで近づいていた。そんなある日、通信班の相原は浮かない表情で医務室を訪れる。佐渡先生から精神疲労の診断を受けた相原は、森雪から立体メージ治療というホログラフを使った治療を受けるが、かえって症状が悪化する。通信室には、沖田艦長が訪れていた。太陽系を出て地球から７万光年の距離にあったが、奇跡的に地球との交信が回復したというのだ。沖田艦長は国連宇宙局ヤマト計画本部と通信をつなぎ、現状を報告するが、そこに気を病んだ相原が乱入してくる・・・。

いよいよ中間地点バラン星に到着したヤマト。沖田艦長は古代と加藤、アナライザーを偵察に出す。アナライザーは、バラン星が惑星の周りを太陽が回っている変わった星だと指摘する。古代と加藤は基地を発見、敵の攻撃を受けるが、そこで無数の動物の死骸や奇妙な植物を発見した。帰艦した古代は、ガミラスの攻撃に利用され虐殺されたバラノドンのためにも基地を叩くべきだと主張。島は４０日以上の遅れが出ているために基地攻撃に反対する。沖田は古代の意見を聞き入れ、後顧の憂いを絶つためとして基地攻撃を命じる。しかしそれは、ドメルの罠だった・・・。

バラン星の人工太陽落下作戦に失敗し、基地を壊滅させてしまったドメルに対し、ガミラス帝国の軍法会議で死刑が宣告される。しかしその決定をデスラー総統は握りつぶした。ドメルを処刑したら誰がヤマトを潰せるのか、という判断である。デスラーは、ドメルに最後の決戦を挑ませるよう命じる。一方ヤマト艦内では技術班がガミラスのデータを分析していた。真田は古代の問いに対し、彼らは地球への移住を考えているのではないかという推論を披露。バラン星基地を奪われて、そのまま黙ってはいないだろうと予想した。そのころ着々とヤマトとの決戦準備をしていたドメルは、ヤマトに対して挑戦状を送るようゲールに命じる。

ドメルの挑戦を受けて立ったヤマトは、七色星団へ向かう。ドメルは空母からガミラス戦闘機隊を発進させ、ヤマトとの間で空中戦となる。そこへ爆撃機隊を瞬間物質移送機でガラ空きになったヤマト上方に送り込み攻撃。ヤマトはどこからともなく現れるガミラス戦闘機隊に翻弄される。そしてついに、ガミラスの戦闘空母から波動砲を封じる必殺兵器、ドリルミサイルを搭載した爆撃機が飛び立った。

とうとうマゼラン星雲までやって来たヤマトは怪電波に船を操られてしまう。しかし音声通信が入り、スターシャがイスカンダルまで誘導電波で導いてくれることがわかる。まもなくイスカンダルに到着するとわかってヤマトの艦内には楽観ムードが漂っていたが、突然イスカンダルの誘導電波が切れてしまう。イスカンダル星は中心の太陽から約３億キロのところにある第８番目の惑星だということは分かったが、島の説明によれば、そのイスカンダル星が２つ現れたという。イスカンダルは二重惑星だったのだ。スクリーンパネルでその姿を確認した矢先、ヤマトはミサイル攻撃を受ける。

濃硫酸の海に誘い込まれ、爆雷の攻撃を受けたヤマトは、ガミラスの地底の空洞を逃げ惑う。ヤマトとの本土決戦に持ち込んだデスラーは、その戦いをまさに楽しんでいた。窮地に陥った古代は艦長室を訪れ、沖田の指示を仰ぐ。沖田はうなだれる古代に「海へ潜れ」と告げるのだった・・・。

ガミラスでの本土決戦に辛くも勝利したヤマトは一路イスカンダルをめざす。スターシャの出迎えを受けた一行は、高度な科学技術を持つその都市を案内されるが、そこにはスターシャ以外の人影はなかった。そのことを知った古代は、スターシャに地球への移住をすすめる。しかしスターシャの、滅び行く星と運命をともにするという決意は固かった。もう一つ、地球には「私の好きになれないタイプの人がいる」ということもあった。そのとき、地球の先行きに不安を覚えた薮ら１２人がイスカンダルへの移住を求めて蜂起する。

イスカンダルを旅立ったヤマトは一路地球を目指す。艦内では放射能除去装置「コスモクリーナーＤ」の組み立て作業が進められていた。宇宙放射線病に冒された沖田艦長は、自身の死期が近づいてきたことを悟っていた。しかし佐渡に、地球を見るまでは絶対に死なないと望郷の思いを吐露する。順調に地球への帰還を続けていたヤマトだが、辛くもガミラス地底都市からの脱出に成功したデスラー総統が波動砲並みの威力を持つ「デスラー砲」でヤマトを狙っていた・・・。