時は近未来。都市生活は巨大なエネルギー「エネトロン」によって支えられていた。しかし、謎の存在「ヴァグラス」が「エネトロン」を狙って動き出す。人類を「ヴァグラス」の脅威から守るため結成されたのが、特命戦隊ゴーバスターズだ。特殊な訓練を受けて戦士となった彼らは、意思を持ったメカ生命体・バディロイドと力を合わせて、恐るべき敵に立ち向かう！
Season 0
18 Episodes
Season 1
50 Episodes
E1 特命戦隊、集結せよ！
E2 13年前の約束
E3 GT-02アニマル、出撃！
E4 特命と決意
E5 キケンな熱暴走！
E6 合体！ゴーバスターオー
E7 エース整備不良?!
E8 マシン設計図を守れ！
E9 ウサダ奪還作戦！
E10 戦う理由
E11 ねらわれたウイークポイント
E12 変装はお好き？
E13 サプライズな休日
E14 サバ？救出作戦
E15 金の戦士と銀のバディ
E16 亜空間から来た男
E17 その名はゴーバスタービート！
E18 地底3000メートルの共同作業
E19 俺の合体！バスターヘラクレス
E20 5体結集！グレートゴーバスター！
E21 さらば ブルーバスター
E22 美しきアバター エスケイプ
E23 意志を継ぐ者
E24 トレビアンな夏祭り
E25 アバターの謎を追え！
E26 小さな強敵！司令室SOS
E27 暴走コンビで迷宮脱出！
E28 ニワトリに注意せよ！
E29 亜空間への突入！
E30 メサイアシャットダウン
E31 宇宙刑事ギャバン、現る！
E32 ギャバンとの友情タッグ！
E33 モーフィン！パワードカスタム
E34 敵はビートバスター?!
E35 タテガミライオー 吼える！
E36 ゴ―バスターライオーガギーン！
E37 黒と白の花嫁
E38 実況！エースデスマッチ
E39 必殺！メサイアの拳
E40 カブるＪとメサイアロイド
E41 怪盗ピンクバスター！
E42 突撃！メガゾードの中へ
E43 決意のクリスマス
E44 聖夜・使命果たすとき
E45 謹賀新年 小さな強敵、再び
E46 新たな融合と熱暴走！
E47 リセットとバックアップ
E48 仕掛けられていた罠
E49 覚悟と選択
E50 永遠のキズナ
