Um professor de folclore é involuntariamente possuído pelos antigos demónios japoneses do Trovão e do Relâmpago. Mas quando o Departamento de Investigação e Defesa Paranormal envia uma equipa de agentes para investigar, uma espada de samurai amaldiçoada envia Hellboy para uma dimensão sobrenatural de fantasmas, monstros e caos feudal. Agora, enquanto a piro cinética Liz Sherman e o menino-peixe Abe Sapien lutam contra um dragão muito irritado, um Hellboy perdido e mal-humorado tem de encontrar o caminho para casa.
