Estamos em 2012, dez anos após as aventuras entre Odaiba e o Mundo Digital. Embora tenham seguido os seus próprios caminhos, Daisuke e os outros DigiDestined e os seus parceiros Digimon continuam unidos pelo mesmo laço. Então, um dia, um Digitama gigante aparece repentinamente no céu acima da Torre de Tóquio, enviando uma mensagem ao mundo. Enquanto o mundo observa, um jovem chamado Oowada Rui aparece diante de Daisuke e seus amigos com um DIGIVICE rachado. Por trás do nascimento dos DigiDestined está o único desejo oculto de Lui.
