A história decorre no ano 2071 , num Japão totalmente destruído por monstros misteriosos chamados Aragami. Uma organização chamada Fernir foi criada para aniquilar os Aragamis utilizando armas chamadas de Arcs God que é feita a partir de células de Aragami. Aqueles que se especializam em matar Aragamis são conhecidos como God Eaters.
