Há quatro anos, um estranho meteorito caiu na Terra, trazendo consigo um poderoso segredo. Ash e Pikachu viajam até à cidade futurista de Larousse. Aí, encontram-se com Tory, um novo amigo que tem medo de Pokémon. Mas uma aurora misteriosa aparece sobre a cidade e com ela surge Deoxys, um Pokémon nunca antes visto! É então que se irá travar uma batalha entre Deoxys e Rayquaza, um outro ser poderoso contra o qual a ajuda de Ash e Pikachu não será suficiente... será preciso a ajuda de todos!
