No futuro, com o crescimento populacional da Terra, a humanidade desenvolveu gigantescas colónias espaciais em órbita, reunidas em aglomerados conhecidos como "Sides". À medida que as elites da Terra obrigam parte da população a ir para o espaço, a rebelião começa. No ano Universal Century 0079, a colónia Side 3 declara-se o Principado de Zeon e inicia a guerra de independência contra a Federação Terrestre. Zeon ganha vantagem no conflito através da utilização de robôs humanoides gigantes chamados mobile suits. O principal piloto de Zeon é Char Aznable, um homem mascarado conhecido como o "Cometa Vermelho". Quando o esquadrão de Char se depara com a Federação a desenvolver o seu próprio protótipo de mobile suit chamado Gundam na colónia Side 7, os seus homens lançam um ataque brutal. Amuro Ray, entra no Gundam e consegue defender-se do ataque de Zeon. Amuro vê-se em conflito com Char, é forçado a fugir numa nave da Federação.
