Ryo Saeba é o melhor "City Hunter" da região e aceita casos com a sua parceira Kaori. Uma modelo chamada Ai Shindo foi atacada e contrata-o para ser o seu guarda-costas. Shinji Mikuni, o presidente de uma empresa de TI que contratou Ai para a sua campanha publicitária, acaba por ser um velho amigo de Kaori, e eles envolvem-se. Enquanto isso, mercenários estão a reunir-se em Shinjuku, e um grande traficante de armas chega ao Japão com uma nova arma, mas com Mikuni no meio, Ryo e Kaori estão a afastar-se.
